La Capilla Mayor se reformó en el siglo XVI según el estilo plateresco de la época. En ella son destacables la cúpula del ábside, obra de Covarrubias, y el retablo, obra de Diego de Velasco. Su importancia radica en las pinturas murales del siglo XIII, en las que se unen los temas cristianos con los motivos geométricos y vegetales de la decoración árabe.
La Iglesia de San Román tiene bóvedas de cañón y escaleras que se desarrollan en cada piso sobre arcos, siendo de madera el último de ellos. La torre-campanario es el elemento más característico de las iglesias mudéjares, y en este caso no es una excepción. Estas torres están inspiradas en los alminares de las mezquitas musulmanas. Su modelo tipológico es el siguiente: basamento de piedra; cuerpo de mampostería encintada con ladrillos en los ángulos; y un cuerpo de remate con dos o tres vanos de perfiles árabes para las campanas.
Hay que destacar el hecho de que en su interior se encuentra el Museo de los Concilios y de la Cultura Visigoda.
Visitar la Iglesia de San Román en Toledo
Para ver el museo del interior de la iglesia, hay que acudir de martes a sábado
de 10:00 a 14:00 h y de 16:00 a 18:00 h. Los domingos abre sus puertas de 9:00 a 15:00 h. Días de cierre: todos los lunes así como determinados festivos. Estos días son el 1, 6 y 23 de enero,1 de mayo, 24, 25 y 31 de diciembre.
El precio de la entrada general es de 2 euros, mientras que la entrada reducida es de 1 euro. Esta entrada está pensada para grupos de 10 o más personas con visita concertada.